那烂陀寺每天都有一百多个讲坛，学习课程包括大乘佛典、天文学、数学、医药等。
1193年突厥人巴克赫提亚尔•卡尔积带兵侵占那烂陀寺，寺院和图书馆遭受严重破坏，大批那烂陀僧侣逃往西藏避难，从此那烂陀寺失去昔日的光辉，并渐渐被遗忘，变成废墟。
那烂陀寺遗迹
从1861年开始，那烂陀寺院遗迹被陆续挖掘，已发掘出8座大型寺院，4座中型寺院和一小型寺院。8大寺按南北方向一字排列，大门朝西。大寺每边9僧室，恰如义净所述，中寺每边7僧室，小寺院每边5僧室。
1861年，英国考古学家亚历山大•康宁汉在这里发现了一片佛教遗址，经过与《大唐西域记》的记载核对，证明这就是那烂陀寺。这里出土了多件精美的佛教石雕，有些石雕只有拳头大小，上面雕刻的佛教故事却异常细腻精美。此外还出土了铜像、铜盘和印章等，其中有一枚刻有“室利那烂陀摩诃毗诃罗僧伽之印”。大部分出土文物都展览在那烂陀寺对面的博物馆里。现在那烂陀寺的发掘面积已经超过了15万平方米。那烂陀寺分为僧院区和教学区。僧院区由大致相近的院落组成，共有12座。每个院落的四周排列着狭窄局促的僧房，院子内有石桌、水井和厨房，每个院落都有走廊通向外面。教学区有寺庙和佛塔。佛子主要在寺庙里学习佛经。周围散布着许多佛塔，其中真身舍利佛塔最富气势，这座塔分三层，外观雕有精美的图案，角楼的壁龛中雕刻着佛陀在菩提伽耶、王舍城和鹿野苑弘法的故事。
那烂陀寺附近有一座中国式的玄奘纪念堂，是中国政府在1957年捐款30万元人民币建造的，以纪念这位中印文化交流的先驱。这也是中印两国人民之间源远流长的传统友谊的最有力的见证。这里是2006年的中印友好活动的主会场。